Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LTBQ06643 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LTBQ06643 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LTBQ06643 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LTBQ06643 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LTBQ06643 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LTBQ06643 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LTBQ06643 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LTBQ06643 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LTBQ06643 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LTBQ06643 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LTBQ06643 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LTBQ06643 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LTBQ06643 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LTBQ06643 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LTBQ06643 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LTBQ06643 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LTBQ06643 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LTBQ06643 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LTBQ06643 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LTBQ06643 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LTBQ06643 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LTBQ06643 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LTBQ06643 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LTBQ06643 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LTBQ06643 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LTBQ06643 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LTBQ06643 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LTBQ06643 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LTBQ06643 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LTBQ06643 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LTBQ06643 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LTBQ06643 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LTBQ06643 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LTBQ06643 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LTBQ06643 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LTBQ06643 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LTBQ06643 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LTBQ06643 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LTBQ06643 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LTBQ06643 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LTBQ06643 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LTBQ06643 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LTBQ06643 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LTBQ06643 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LTBQ06643 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LTBQ06643 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LTBQ06643 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LTBQ06643 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LTBQ06643 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LTBQ06643 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LTBQ06643 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LTBQ06643 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LTBQ06643 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LTBQ06643 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LTBQ06643 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LTBQ06643 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LTBQ06643 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LTBQ06643 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LTBQ06643 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LTBQ06643 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LTBQ06643 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LTBQ06643 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LTBQ06643 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LTBQ06643 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LTBQ06643 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LTBQ06643 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LTBQ06643 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LTBQ06643 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LTBQ06643 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LTBQ06643 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LTBQ06643 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LTBQ06643 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LTBQ06643 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LTBQ06643 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LTBQ06643 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LTBQ06643 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
LTBQ06643 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
LTBQ06643 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
LTBQ06643 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LTBQ06643 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LTBQ06643 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LTBQ06643 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LTBQ06643 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LTBQ06643 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LTBQ06643 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LTBQ06643 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LTBQ06643 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LTBQ06643 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LTBQ06643 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LTBQ06643 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LTBQ06643 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LTBQ06643 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LTBQ06643 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LTBQ06643 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LTBQ06643 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LTBQ06643 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LTBQ06643 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LTBQ06643 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LTBQ06643 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms