Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC12.57□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 AC087273.1-201ENST00000519368 529 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 AL109620.1-201ENST00000618738 1197 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC12.56□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 AL359644.1-204ENST00000440807 440 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 AL139353.2-202ENST00000502430 1213 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 AC116337.3-201ENST00000505200 846 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
TNP2Q05952 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms