Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CD164Q04900 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CD164Q04900 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CD164Q04900 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CD164Q04900 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CD164Q04900 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CD164Q04900 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CD164Q04900 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CD164Q04900 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CD164Q04900 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
CD164Q04900 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CD164Q04900 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CD164Q04900 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CD164Q04900 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CD164Q04900 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CD164Q04900 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CD164Q04900 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
CD164Q04900 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CD164Q04900 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CD164Q04900 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CD164Q04900 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CD164Q04900 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CD164Q04900 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CD164Q04900 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CD164Q04900 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CD164Q04900 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CD164Q04900 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
CD164Q04900 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CD164Q04900 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
CD164Q04900 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CD164Q04900 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
CD164Q04900 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CD164Q04900 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CD164Q04900 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CD164Q04900 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
CD164Q04900 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CD164Q04900 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CD164Q04900 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
CD164Q04900 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CD164Q04900 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
CD164Q04900 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CD164Q04900 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CD164Q04900 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CD164Q04900 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CD164Q04900 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CD164Q04900 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CD164Q04900 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CD164Q04900 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CD164Q04900 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CD164Q04900 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CD164Q04900 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
CD164Q04900 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CD164Q04900 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CD164Q04900 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CD164Q04900 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CD164Q04900 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CD164Q04900 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CD164Q04900 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CD164Q04900 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CD164Q04900 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
CD164Q04900 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
CD164Q04900 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CD164Q04900 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CD164Q04900 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CD164Q04900 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CD164Q04900 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CD164Q04900 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CD164Q04900 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CD164Q04900 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CD164Q04900 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CD164Q04900 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CD164Q04900 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CD164Q04900 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CD164Q04900 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CD164Q04900 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
CD164Q04900 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CD164Q04900 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CD164Q04900 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CD164Q04900 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CD164Q04900 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CD164Q04900 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CD164Q04900 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CD164Q04900 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CD164Q04900 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CD164Q04900 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CD164Q04900 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CD164Q04900 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CD164Q04900 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CD164Q04900 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CD164Q04900 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
CD164Q04900 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CD164Q04900 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CD164Q04900 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CD164Q04900 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
CD164Q04900 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CD164Q04900 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CD164Q04900 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CD164Q04900 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
CD164Q04900 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
CD164Q04900 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms