Protein–RNA interactions for Protein: Q04743

EMX2, Homeobox protein EMX2, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX2Q04743 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EMX2Q04743 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms