Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CAV1Q03135 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CAV1Q03135 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms