Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PLOD1Q02809 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PLOD1Q02809 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms