Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
EXOSC10Q01780 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
EXOSC10Q01780 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms