Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
E2F1Q01094 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms