Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.02■□□□□ -0
PRCDQ00LT1 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PRCDQ00LT1 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PRCDQ00LT1 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PRCDQ00LT1 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
PRCDQ00LT1 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PRCDQ00LT1 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PRCDQ00LT1 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PRCDQ00LT1 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PRCDQ00LT1 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PRCDQ00LT1 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
PRCDQ00LT1 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
PRCDQ00LT1 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PRCDQ00LT1 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRCDQ00LT1 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRCDQ00LT1 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRCDQ00LT1 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRCDQ00LT1 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRCDQ00LT1 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRCDQ00LT1 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRCDQ00LT1 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRCDQ00LT1 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRCDQ00LT1 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRCDQ00LT1 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PRCDQ00LT1 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms