Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FANCCQ00597 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FANCCQ00597 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms