Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TFAMQ00059 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TFAMQ00059 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms