Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FAM3AP98173 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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