Protein–RNA interactions for Protein: P84074

HPCA, Neuron-specific calcium-binding protein hippocalcin, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAP84074 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HPCAP84074 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HPCAP84074 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPCAP84074 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPCAP84074 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPCAP84074 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPCAP84074 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPCAP84074 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPCAP84074 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPCAP84074 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPCAP84074 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPCAP84074 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPCAP84074 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPCAP84074 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPCAP84074 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HPCAP84074 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPCAP84074 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPCAP84074 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HPCAP84074 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPCAP84074 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPCAP84074 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPCAP84074 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPCAP84074 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPCAP84074 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HPCAP84074 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HPCAP84074 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HPCAP84074 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HPCAP84074 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HPCAP84074 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HPCAP84074 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HPCAP84074 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HPCAP84074 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPCAP84074 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPCAP84074 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPCAP84074 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPCAP84074 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPCAP84074 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPCAP84074 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPCAP84074 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPCAP84074 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPCAP84074 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPCAP84074 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPCAP84074 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPCAP84074 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPCAP84074 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPCAP84074 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPCAP84074 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPCAP84074 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPCAP84074 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPCAP84074 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPCAP84074 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPCAP84074 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPCAP84074 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPCAP84074 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPCAP84074 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPCAP84074 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPCAP84074 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPCAP84074 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPCAP84074 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HPCAP84074 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HPCAP84074 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HPCAP84074 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HPCAP84074 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HPCAP84074 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HPCAP84074 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HPCAP84074 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HPCAP84074 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HPCAP84074 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HPCAP84074 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HPCAP84074 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HPCAP84074 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HPCAP84074 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HPCAP84074 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HPCAP84074 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HPCAP84074 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HPCAP84074 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HPCAP84074 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HPCAP84074 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
HPCAP84074 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HPCAP84074 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HPCAP84074 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HPCAP84074 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HPCAP84074 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HPCAP84074 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HPCAP84074 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HPCAP84074 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HPCAP84074 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HPCAP84074 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HPCAP84074 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HPCAP84074 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HPCAP84074 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HPCAP84074 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPCAP84074 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPCAP84074 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPCAP84074 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPCAP84074 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPCAP84074 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPCAP84074 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPCAP84074 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HPCAP84074 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms