Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IRX6P78412 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IRX6P78412 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IRX6P78412 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IRX6P78412 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IRX6P78412 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IRX6P78412 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IRX6P78412 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IRX6P78412 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IRX6P78412 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IRX6P78412 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IRX6P78412 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IRX6P78412 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IRX6P78412 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IRX6P78412 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IRX6P78412 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
IRX6P78412 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IRX6P78412 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IRX6P78412 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IRX6P78412 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IRX6P78412 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IRX6P78412 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IRX6P78412 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IRX6P78412 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IRX6P78412 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IRX6P78412 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IRX6P78412 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IRX6P78412 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IRX6P78412 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
IRX6P78412 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IRX6P78412 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IRX6P78412 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IRX6P78412 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IRX6P78412 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IRX6P78412 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
IRX6P78412 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
IRX6P78412 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IRX6P78412 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IRX6P78412 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IRX6P78412 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
IRX6P78412 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IRX6P78412 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IRX6P78412 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IRX6P78412 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IRX6P78412 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IRX6P78412 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IRX6P78412 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IRX6P78412 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IRX6P78412 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IRX6P78412 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IRX6P78412 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IRX6P78412 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IRX6P78412 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IRX6P78412 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IRX6P78412 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IRX6P78412 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IRX6P78412 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IRX6P78412 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IRX6P78412 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IRX6P78412 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IRX6P78412 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IRX6P78412 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IRX6P78412 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IRX6P78412 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IRX6P78412 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
IRX6P78412 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IRX6P78412 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
IRX6P78412 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IRX6P78412 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IRX6P78412 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IRX6P78412 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IRX6P78412 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IRX6P78412 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IRX6P78412 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IRX6P78412 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IRX6P78412 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IRX6P78412 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IRX6P78412 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IRX6P78412 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IRX6P78412 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IRX6P78412 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IRX6P78412 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IRX6P78412 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IRX6P78412 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IRX6P78412 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IRX6P78412 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IRX6P78412 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IRX6P78412 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IRX6P78412 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IRX6P78412 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IRX6P78412 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
IRX6P78412 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IRX6P78412 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IRX6P78412 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IRX6P78412 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IRX6P78412 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IRX6P78412 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IRX6P78412 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IRX6P78412 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IRX6P78412 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms