Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CSNK2A1P68400 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CSNK2A1P68400 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms