Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKP1P63208 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKP1P63208 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKP1P63208 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKP1P63208 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SKP1P63208 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKP1P63208 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKP1P63208 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKP1P63208 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SKP1P63208 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKP1P63208 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKP1P63208 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKP1P63208 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SKP1P63208 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKP1P63208 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKP1P63208 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKP1P63208 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKP1P63208 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKP1P63208 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKP1P63208 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKP1P63208 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKP1P63208 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKP1P63208 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKP1P63208 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKP1P63208 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKP1P63208 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SKP1P63208 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SKP1P63208 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKP1P63208 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKP1P63208 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SKP1P63208 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKP1P63208 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SKP1P63208 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKP1P63208 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKP1P63208 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SKP1P63208 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKP1P63208 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKP1P63208 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKP1P63208 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKP1P63208 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKP1P63208 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKP1P63208 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKP1P63208 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SKP1P63208 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKP1P63208 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKP1P63208 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKP1P63208 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKP1P63208 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKP1P63208 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKP1P63208 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKP1P63208 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKP1P63208 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKP1P63208 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKP1P63208 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKP1P63208 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKP1P63208 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKP1P63208 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKP1P63208 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKP1P63208 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKP1P63208 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKP1P63208 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKP1P63208 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKP1P63208 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SKP1P63208 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKP1P63208 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKP1P63208 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SKP1P63208 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKP1P63208 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKP1P63208 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKP1P63208 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKP1P63208 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKP1P63208 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKP1P63208 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKP1P63208 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKP1P63208 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SKP1P63208 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKP1P63208 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SKP1P63208 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKP1P63208 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKP1P63208 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKP1P63208 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKP1P63208 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKP1P63208 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKP1P63208 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKP1P63208 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKP1P63208 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKP1P63208 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKP1P63208 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKP1P63208 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SKP1P63208 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKP1P63208 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKP1P63208 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKP1P63208 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKP1P63208 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKP1P63208 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKP1P63208 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKP1P63208 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKP1P63208 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKP1P63208 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SKP1P63208 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms