Protein–RNA interactions for Protein: P62987

UBA52, Ubiquitin-60S ribosomal protein L40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA52P62987 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
UBA52P62987 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBA52P62987 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBA52P62987 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBA52P62987 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBA52P62987 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBA52P62987 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBA52P62987 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBA52P62987 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBA52P62987 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBA52P62987 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBA52P62987 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBA52P62987 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBA52P62987 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBA52P62987 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBA52P62987 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBA52P62987 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBA52P62987 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBA52P62987 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBA52P62987 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBA52P62987 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBA52P62987 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBA52P62987 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBA52P62987 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBA52P62987 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBA52P62987 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBA52P62987 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBA52P62987 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBA52P62987 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBA52P62987 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBA52P62987 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBA52P62987 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBA52P62987 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBA52P62987 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBA52P62987 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBA52P62987 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBA52P62987 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBA52P62987 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBA52P62987 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBA52P62987 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBA52P62987 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBA52P62987 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBA52P62987 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBA52P62987 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBA52P62987 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBA52P62987 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBA52P62987 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBA52P62987 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBA52P62987 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBA52P62987 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBA52P62987 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBA52P62987 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBA52P62987 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBA52P62987 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBA52P62987 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBA52P62987 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBA52P62987 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBA52P62987 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBA52P62987 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBA52P62987 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBA52P62987 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBA52P62987 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBA52P62987 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBA52P62987 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBA52P62987 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBA52P62987 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBA52P62987 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBA52P62987 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBA52P62987 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBA52P62987 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBA52P62987 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBA52P62987 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBA52P62987 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBA52P62987 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBA52P62987 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBA52P62987 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBA52P62987 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBA52P62987 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBA52P62987 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBA52P62987 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBA52P62987 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBA52P62987 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBA52P62987 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBA52P62987 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBA52P62987 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBA52P62987 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBA52P62987 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBA52P62987 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBA52P62987 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBA52P62987 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBA52P62987 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBA52P62987 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBA52P62987 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
UBA52P62987 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
UBA52P62987 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
UBA52P62987 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
UBA52P62987 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
UBA52P62987 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
UBA52P62987 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
UBA52P62987 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms