Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO4P61968 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO4P61968 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO4P61968 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO4P61968 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO4P61968 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO4P61968 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO4P61968 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO4P61968 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO4P61968 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO4P61968 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO4P61968 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO4P61968 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO4P61968 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO4P61968 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO4P61968 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO4P61968 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LMO4P61968 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LMO4P61968 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LMO4P61968 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LMO4P61968 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO4P61968 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO4P61968 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO4P61968 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO4P61968 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO4P61968 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO4P61968 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO4P61968 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO4P61968 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO4P61968 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO4P61968 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO4P61968 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO4P61968 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO4P61968 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO4P61968 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO4P61968 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO4P61968 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO4P61968 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO4P61968 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO4P61968 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO4P61968 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO4P61968 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO4P61968 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO4P61968 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO4P61968 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO4P61968 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO4P61968 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO4P61968 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO4P61968 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO4P61968 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO4P61968 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO4P61968 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LMO4P61968 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO4P61968 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO4P61968 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO4P61968 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO4P61968 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO4P61968 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO4P61968 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO4P61968 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO4P61968 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO4P61968 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO4P61968 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO4P61968 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO4P61968 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO4P61968 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO4P61968 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO4P61968 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO4P61968 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO4P61968 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO4P61968 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO4P61968 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO4P61968 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO4P61968 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO4P61968 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO4P61968 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO4P61968 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO4P61968 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO4P61968 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO4P61968 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO4P61968 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO4P61968 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO4P61968 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LMO4P61968 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO4P61968 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO4P61968 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO4P61968 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO4P61968 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO4P61968 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO4P61968 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO4P61968 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO4P61968 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO4P61968 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO4P61968 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO4P61968 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO4P61968 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO4P61968 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO4P61968 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO4P61968 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LMO4P61968 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms