Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLR2FP61218 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLR2FP61218 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
POLR2FP61218 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLR2FP61218 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLR2FP61218 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLR2FP61218 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLR2FP61218 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLR2FP61218 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLR2FP61218 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
POLR2FP61218 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR2FP61218 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR2FP61218 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR2FP61218 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR2FP61218 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR2FP61218 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR2FP61218 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR2FP61218 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR2FP61218 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR2FP61218 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR2FP61218 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR2FP61218 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR2FP61218 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR2FP61218 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR2FP61218 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR2FP61218 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR2FP61218 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR2FP61218 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR2FP61218 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR2FP61218 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR2FP61218 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR2FP61218 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR2FP61218 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR2FP61218 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR2FP61218 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR2FP61218 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR2FP61218 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR2FP61218 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR2FP61218 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR2FP61218 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
POLR2FP61218 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR2FP61218 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR2FP61218 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR2FP61218 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR2FP61218 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR2FP61218 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR2FP61218 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR2FP61218 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR2FP61218 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR2FP61218 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR2FP61218 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR2FP61218 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR2FP61218 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR2FP61218 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR2FP61218 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR2FP61218 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR2FP61218 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR2FP61218 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR2FP61218 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR2FP61218 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR2FP61218 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR2FP61218 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR2FP61218 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR2FP61218 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR2FP61218 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR2FP61218 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR2FP61218 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR2FP61218 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR2FP61218 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR2FP61218 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR2FP61218 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR2FP61218 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
POLR2FP61218 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2FP61218 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2FP61218 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2FP61218 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2FP61218 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2FP61218 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2FP61218 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2FP61218 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2FP61218 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2FP61218 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2FP61218 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2FP61218 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2FP61218 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2FP61218 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2FP61218 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2FP61218 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2FP61218 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2FP61218 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2FP61218 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2FP61218 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2FP61218 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2FP61218 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2FP61218 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2FP61218 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2FP61218 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2FP61218 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2FP61218 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
POLR2FP61218 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms