Protein–RNA interactions for Protein: P60842

EIF4A1, Eukaryotic initiation factor 4A-I, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4A1P60842 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EIF4A1P60842 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EIF4A1P60842 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EIF4A1P60842 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EIF4A1P60842 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EIF4A1P60842 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EIF4A1P60842 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EIF4A1P60842 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EIF4A1P60842 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EIF4A1P60842 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EIF4A1P60842 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EIF4A1P60842 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EIF4A1P60842 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EIF4A1P60842 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EIF4A1P60842 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EIF4A1P60842 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
EIF4A1P60842 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EIF4A1P60842 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
EIF4A1P60842 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EIF4A1P60842 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EIF4A1P60842 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EIF4A1P60842 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EIF4A1P60842 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EIF4A1P60842 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EIF4A1P60842 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EIF4A1P60842 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
EIF4A1P60842 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EIF4A1P60842 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
EIF4A1P60842 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EIF4A1P60842 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EIF4A1P60842 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EIF4A1P60842 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
EIF4A1P60842 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EIF4A1P60842 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EIF4A1P60842 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EIF4A1P60842 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EIF4A1P60842 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EIF4A1P60842 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EIF4A1P60842 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EIF4A1P60842 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EIF4A1P60842 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EIF4A1P60842 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
EIF4A1P60842 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EIF4A1P60842 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EIF4A1P60842 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EIF4A1P60842 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EIF4A1P60842 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EIF4A1P60842 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EIF4A1P60842 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EIF4A1P60842 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EIF4A1P60842 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EIF4A1P60842 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EIF4A1P60842 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EIF4A1P60842 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EIF4A1P60842 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EIF4A1P60842 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
EIF4A1P60842 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EIF4A1P60842 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EIF4A1P60842 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EIF4A1P60842 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EIF4A1P60842 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EIF4A1P60842 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EIF4A1P60842 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EIF4A1P60842 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EIF4A1P60842 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EIF4A1P60842 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EIF4A1P60842 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
EIF4A1P60842 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
EIF4A1P60842 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EIF4A1P60842 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EIF4A1P60842 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EIF4A1P60842 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EIF4A1P60842 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EIF4A1P60842 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EIF4A1P60842 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EIF4A1P60842 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EIF4A1P60842 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
EIF4A1P60842 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
EIF4A1P60842 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EIF4A1P60842 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EIF4A1P60842 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EIF4A1P60842 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EIF4A1P60842 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EIF4A1P60842 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EIF4A1P60842 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EIF4A1P60842 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EIF4A1P60842 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EIF4A1P60842 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EIF4A1P60842 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EIF4A1P60842 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EIF4A1P60842 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EIF4A1P60842 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EIF4A1P60842 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EIF4A1P60842 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EIF4A1P60842 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EIF4A1P60842 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EIF4A1P60842 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EIF4A1P60842 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EIF4A1P60842 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EIF4A1P60842 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.4 ms