Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CABP4P57796 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CABP4P57796 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CABP4P57796 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CABP4P57796 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CABP4P57796 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CABP4P57796 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CABP4P57796 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CABP4P57796 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CABP4P57796 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CABP4P57796 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CABP4P57796 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CABP4P57796 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CABP4P57796 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CABP4P57796 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CABP4P57796 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CABP4P57796 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CABP4P57796 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CABP4P57796 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CABP4P57796 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CABP4P57796 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CABP4P57796 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CABP4P57796 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CABP4P57796 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CABP4P57796 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CABP4P57796 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CABP4P57796 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CABP4P57796 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CABP4P57796 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CABP4P57796 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CABP4P57796 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CABP4P57796 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CABP4P57796 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CABP4P57796 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CABP4P57796 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CABP4P57796 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CABP4P57796 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CABP4P57796 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CABP4P57796 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CABP4P57796 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CABP4P57796 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CABP4P57796 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CABP4P57796 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CABP4P57796 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CABP4P57796 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CABP4P57796 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CABP4P57796 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CABP4P57796 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CABP4P57796 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CABP4P57796 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CABP4P57796 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CABP4P57796 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CABP4P57796 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CABP4P57796 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CABP4P57796 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CABP4P57796 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CABP4P57796 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CABP4P57796 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CABP4P57796 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CABP4P57796 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CABP4P57796 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CABP4P57796 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CABP4P57796 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CABP4P57796 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CABP4P57796 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CABP4P57796 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CABP4P57796 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CABP4P57796 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CABP4P57796 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CABP4P57796 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CABP4P57796 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CABP4P57796 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CABP4P57796 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CABP4P57796 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CABP4P57796 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CABP4P57796 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CABP4P57796 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CABP4P57796 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CABP4P57796 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CABP4P57796 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CABP4P57796 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CABP4P57796 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CABP4P57796 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CABP4P57796 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CABP4P57796 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CABP4P57796 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CABP4P57796 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CABP4P57796 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CABP4P57796 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CABP4P57796 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CABP4P57796 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CABP4P57796 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CABP4P57796 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CABP4P57796 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CABP4P57796 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CABP4P57796 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CABP4P57796 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CABP4P57796 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CABP4P57796 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CABP4P57796 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms