Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SIK1P57059 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SIK1P57059 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SIK1P57059 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SIK1P57059 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SIK1P57059 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SIK1P57059 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SIK1P57059 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SIK1P57059 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIK1P57059 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIK1P57059 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIK1P57059 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIK1P57059 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SIK1P57059 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SIK1P57059 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIK1P57059 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIK1P57059 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIK1P57059 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIK1P57059 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIK1P57059 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SIK1P57059 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SIK1P57059 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SIK1P57059 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIK1P57059 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIK1P57059 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIK1P57059 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIK1P57059 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIK1P57059 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIK1P57059 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIK1P57059 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIK1P57059 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIK1P57059 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIK1P57059 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIK1P57059 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SIK1P57059 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SIK1P57059 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIK1P57059 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIK1P57059 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIK1P57059 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIK1P57059 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIK1P57059 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIK1P57059 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SIK1P57059 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIK1P57059 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIK1P57059 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SIK1P57059 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SIK1P57059 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIK1P57059 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIK1P57059 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIK1P57059 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIK1P57059 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SIK1P57059 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIK1P57059 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIK1P57059 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIK1P57059 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIK1P57059 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIK1P57059 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIK1P57059 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SIK1P57059 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIK1P57059 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SIK1P57059 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIK1P57059 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIK1P57059 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIK1P57059 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIK1P57059 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIK1P57059 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIK1P57059 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIK1P57059 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIK1P57059 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIK1P57059 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIK1P57059 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SIK1P57059 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SIK1P57059 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIK1P57059 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIK1P57059 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIK1P57059 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIK1P57059 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIK1P57059 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIK1P57059 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIK1P57059 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIK1P57059 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIK1P57059 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIK1P57059 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIK1P57059 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIK1P57059 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIK1P57059 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIK1P57059 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SIK1P57059 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIK1P57059 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIK1P57059 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIK1P57059 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIK1P57059 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIK1P57059 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIK1P57059 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SIK1P57059 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIK1P57059 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIK1P57059 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIK1P57059 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIK1P57059 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SIK1P57059 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms