Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
H2BFSP57053 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2BFSP57053 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms