Protein–RNA interactions for Protein: P56282

POLE2, DNA polymerase epsilon subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE2P56282 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLE2P56282 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLE2P56282 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLE2P56282 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLE2P56282 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLE2P56282 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLE2P56282 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
POLE2P56282 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLE2P56282 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLE2P56282 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
POLE2P56282 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLE2P56282 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLE2P56282 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLE2P56282 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLE2P56282 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLE2P56282 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLE2P56282 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLE2P56282 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLE2P56282 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLE2P56282 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLE2P56282 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLE2P56282 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLE2P56282 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLE2P56282 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLE2P56282 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLE2P56282 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLE2P56282 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLE2P56282 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLE2P56282 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLE2P56282 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLE2P56282 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLE2P56282 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
POLE2P56282 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLE2P56282 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLE2P56282 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLE2P56282 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLE2P56282 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLE2P56282 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLE2P56282 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLE2P56282 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLE2P56282 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLE2P56282 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
POLE2P56282 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
POLE2P56282 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
POLE2P56282 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
POLE2P56282 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
POLE2P56282 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLE2P56282 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLE2P56282 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLE2P56282 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLE2P56282 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLE2P56282 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLE2P56282 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLE2P56282 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLE2P56282 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLE2P56282 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLE2P56282 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLE2P56282 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
POLE2P56282 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLE2P56282 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLE2P56282 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLE2P56282 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLE2P56282 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLE2P56282 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLE2P56282 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLE2P56282 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLE2P56282 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLE2P56282 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLE2P56282 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLE2P56282 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLE2P56282 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLE2P56282 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
POLE2P56282 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLE2P56282 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
POLE2P56282 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLE2P56282 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLE2P56282 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLE2P56282 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLE2P56282 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLE2P56282 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLE2P56282 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLE2P56282 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLE2P56282 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLE2P56282 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLE2P56282 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLE2P56282 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLE2P56282 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLE2P56282 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLE2P56282 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLE2P56282 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLE2P56282 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
POLE2P56282 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
POLE2P56282 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLE2P56282 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLE2P56282 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLE2P56282 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLE2P56282 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLE2P56282 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLE2P56282 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
POLE2P56282 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms