Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RAD23BP54727 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155.7 ms