Protein–RNA interactions for Protein: P54132

BLM, Bloom syndrome protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BLMP54132 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BLMP54132 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BLMP54132 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BLMP54132 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BLMP54132 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BLMP54132 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
BLMP54132 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BLMP54132 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BLMP54132 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BLMP54132 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BLMP54132 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BLMP54132 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BLMP54132 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BLMP54132 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BLMP54132 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BLMP54132 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BLMP54132 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
BLMP54132 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BLMP54132 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BLMP54132 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BLMP54132 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
BLMP54132 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BLMP54132 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
BLMP54132 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BLMP54132 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
BLMP54132 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
BLMP54132 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
BLMP54132 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BLMP54132 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BLMP54132 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BLMP54132 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BLMP54132 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BLMP54132 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BLMP54132 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
BLMP54132 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BLMP54132 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BLMP54132 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BLMP54132 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
BLMP54132 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BLMP54132 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BLMP54132 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BLMP54132 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BLMP54132 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BLMP54132 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BLMP54132 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BLMP54132 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BLMP54132 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BLMP54132 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BLMP54132 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BLMP54132 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BLMP54132 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BLMP54132 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BLMP54132 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BLMP54132 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BLMP54132 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BLMP54132 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BLMP54132 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BLMP54132 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
BLMP54132 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BLMP54132 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BLMP54132 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BLMP54132 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BLMP54132 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BLMP54132 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BLMP54132 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BLMP54132 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BLMP54132 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BLMP54132 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BLMP54132 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BLMP54132 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BLMP54132 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BLMP54132 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
BLMP54132 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BLMP54132 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BLMP54132 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BLMP54132 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BLMP54132 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BLMP54132 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
BLMP54132 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BLMP54132 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BLMP54132 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BLMP54132 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
BLMP54132 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BLMP54132 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BLMP54132 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BLMP54132 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BLMP54132 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BLMP54132 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BLMP54132 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BLMP54132 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
BLMP54132 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BLMP54132 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BLMP54132 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BLMP54132 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BLMP54132 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
BLMP54132 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
BLMP54132 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
BLMP54132 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BLMP54132 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BLMP54132 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms