Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CSNK1EP49674 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms