Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK8P49336 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK8P49336 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK8P49336 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK8P49336 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK8P49336 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK8P49336 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDK8P49336 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDK8P49336 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDK8P49336 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDK8P49336 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDK8P49336 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
CDK8P49336 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK8P49336 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK8P49336 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK8P49336 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK8P49336 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK8P49336 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK8P49336 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK8P49336 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK8P49336 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK8P49336 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK8P49336 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK8P49336 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK8P49336 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK8P49336 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK8P49336 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK8P49336 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK8P49336 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK8P49336 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK8P49336 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK8P49336 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK8P49336 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK8P49336 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK8P49336 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK8P49336 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK8P49336 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK8P49336 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK8P49336 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK8P49336 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK8P49336 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK8P49336 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDK8P49336 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK8P49336 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK8P49336 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK8P49336 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK8P49336 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK8P49336 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK8P49336 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK8P49336 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK8P49336 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK8P49336 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK8P49336 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK8P49336 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK8P49336 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK8P49336 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK8P49336 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK8P49336 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK8P49336 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK8P49336 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK8P49336 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK8P49336 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK8P49336 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK8P49336 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK8P49336 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK8P49336 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK8P49336 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK8P49336 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK8P49336 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CDK8P49336 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK8P49336 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK8P49336 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK8P49336 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK8P49336 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK8P49336 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK8P49336 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK8P49336 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK8P49336 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK8P49336 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK8P49336 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK8P49336 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK8P49336 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK8P49336 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK8P49336 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK8P49336 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK8P49336 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK8P49336 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK8P49336 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK8P49336 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK8P49336 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK8P49336 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK8P49336 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK8P49336 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK8P49336 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK8P49336 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDK8P49336 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK8P49336 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK8P49336 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK8P49336 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDK8P49336 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms