Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTDSS1P48651 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms