Protein–RNA interactions for Protein: P46094

XCR1, Chemokine XC receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCR1P46094 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
XCR1P46094 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
XCR1P46094 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
XCR1P46094 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
XCR1P46094 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
XCR1P46094 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
XCR1P46094 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
XCR1P46094 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
XCR1P46094 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
XCR1P46094 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
XCR1P46094 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
XCR1P46094 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
XCR1P46094 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
XCR1P46094 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
XCR1P46094 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
XCR1P46094 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
XCR1P46094 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
XCR1P46094 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
XCR1P46094 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
XCR1P46094 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
XCR1P46094 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
XCR1P46094 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
XCR1P46094 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
XCR1P46094 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
XCR1P46094 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
XCR1P46094 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
XCR1P46094 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
XCR1P46094 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
XCR1P46094 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
XCR1P46094 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
XCR1P46094 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
XCR1P46094 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
XCR1P46094 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
XCR1P46094 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
XCR1P46094 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
XCR1P46094 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
XCR1P46094 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
XCR1P46094 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
XCR1P46094 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
XCR1P46094 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
XCR1P46094 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
XCR1P46094 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
XCR1P46094 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
XCR1P46094 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
XCR1P46094 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
XCR1P46094 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
XCR1P46094 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
XCR1P46094 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
XCR1P46094 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
XCR1P46094 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
XCR1P46094 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
XCR1P46094 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
XCR1P46094 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
XCR1P46094 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
XCR1P46094 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
XCR1P46094 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
XCR1P46094 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
XCR1P46094 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
XCR1P46094 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
XCR1P46094 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
XCR1P46094 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
XCR1P46094 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
XCR1P46094 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
XCR1P46094 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
XCR1P46094 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
XCR1P46094 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
XCR1P46094 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
XCR1P46094 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
XCR1P46094 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
XCR1P46094 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
XCR1P46094 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
XCR1P46094 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
XCR1P46094 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
XCR1P46094 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
XCR1P46094 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
XCR1P46094 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
XCR1P46094 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
XCR1P46094 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
XCR1P46094 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
XCR1P46094 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
XCR1P46094 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
XCR1P46094 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
XCR1P46094 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
XCR1P46094 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
XCR1P46094 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
XCR1P46094 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
XCR1P46094 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
XCR1P46094 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
XCR1P46094 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
XCR1P46094 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
XCR1P46094 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
XCR1P46094 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
XCR1P46094 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
XCR1P46094 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
XCR1P46094 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
XCR1P46094 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
XCR1P46094 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
XCR1P46094 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
XCR1P46094 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
XCR1P46094 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms