Protein–RNA interactions for Protein: P45880

VDAC2, Voltage-dependent anion-selective channel protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VDAC2P45880 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VDAC2P45880 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VDAC2P45880 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VDAC2P45880 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VDAC2P45880 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VDAC2P45880 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VDAC2P45880 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VDAC2P45880 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VDAC2P45880 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VDAC2P45880 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VDAC2P45880 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VDAC2P45880 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VDAC2P45880 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VDAC2P45880 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VDAC2P45880 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VDAC2P45880 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VDAC2P45880 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VDAC2P45880 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VDAC2P45880 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VDAC2P45880 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VDAC2P45880 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VDAC2P45880 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VDAC2P45880 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VDAC2P45880 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VDAC2P45880 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VDAC2P45880 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VDAC2P45880 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VDAC2P45880 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VDAC2P45880 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VDAC2P45880 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VDAC2P45880 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VDAC2P45880 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VDAC2P45880 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VDAC2P45880 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VDAC2P45880 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VDAC2P45880 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VDAC2P45880 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VDAC2P45880 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VDAC2P45880 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VDAC2P45880 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VDAC2P45880 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VDAC2P45880 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VDAC2P45880 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VDAC2P45880 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VDAC2P45880 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VDAC2P45880 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VDAC2P45880 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VDAC2P45880 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VDAC2P45880 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VDAC2P45880 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VDAC2P45880 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VDAC2P45880 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VDAC2P45880 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VDAC2P45880 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VDAC2P45880 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VDAC2P45880 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VDAC2P45880 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VDAC2P45880 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VDAC2P45880 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VDAC2P45880 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VDAC2P45880 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VDAC2P45880 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VDAC2P45880 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VDAC2P45880 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VDAC2P45880 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VDAC2P45880 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VDAC2P45880 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VDAC2P45880 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VDAC2P45880 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VDAC2P45880 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VDAC2P45880 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VDAC2P45880 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VDAC2P45880 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VDAC2P45880 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VDAC2P45880 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VDAC2P45880 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VDAC2P45880 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VDAC2P45880 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VDAC2P45880 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VDAC2P45880 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VDAC2P45880 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VDAC2P45880 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VDAC2P45880 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VDAC2P45880 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
VDAC2P45880 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VDAC2P45880 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VDAC2P45880 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VDAC2P45880 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VDAC2P45880 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VDAC2P45880 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VDAC2P45880 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VDAC2P45880 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VDAC2P45880 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VDAC2P45880 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VDAC2P45880 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VDAC2P45880 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VDAC2P45880 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VDAC2P45880 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VDAC2P45880 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VDAC2P45880 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms