Protein–RNA interactions for Protein: P43694

GATA4, Transcription factor GATA-4, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA4P43694 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GATA4P43694 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GATA4P43694 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GATA4P43694 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GATA4P43694 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GATA4P43694 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GATA4P43694 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GATA4P43694 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GATA4P43694 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GATA4P43694 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GATA4P43694 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GATA4P43694 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GATA4P43694 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GATA4P43694 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GATA4P43694 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GATA4P43694 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GATA4P43694 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GATA4P43694 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GATA4P43694 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GATA4P43694 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GATA4P43694 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GATA4P43694 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GATA4P43694 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GATA4P43694 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GATA4P43694 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GATA4P43694 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GATA4P43694 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GATA4P43694 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GATA4P43694 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GATA4P43694 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GATA4P43694 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GATA4P43694 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GATA4P43694 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GATA4P43694 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GATA4P43694 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GATA4P43694 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GATA4P43694 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GATA4P43694 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GATA4P43694 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GATA4P43694 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GATA4P43694 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GATA4P43694 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GATA4P43694 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GATA4P43694 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GATA4P43694 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GATA4P43694 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GATA4P43694 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GATA4P43694 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GATA4P43694 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GATA4P43694 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GATA4P43694 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GATA4P43694 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GATA4P43694 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GATA4P43694 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GATA4P43694 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GATA4P43694 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GATA4P43694 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GATA4P43694 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GATA4P43694 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GATA4P43694 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GATA4P43694 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GATA4P43694 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GATA4P43694 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GATA4P43694 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GATA4P43694 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GATA4P43694 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GATA4P43694 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GATA4P43694 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GATA4P43694 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GATA4P43694 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GATA4P43694 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GATA4P43694 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GATA4P43694 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GATA4P43694 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GATA4P43694 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GATA4P43694 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GATA4P43694 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GATA4P43694 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GATA4P43694 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GATA4P43694 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GATA4P43694 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GATA4P43694 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GATA4P43694 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GATA4P43694 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GATA4P43694 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GATA4P43694 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GATA4P43694 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GATA4P43694 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GATA4P43694 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GATA4P43694 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GATA4P43694 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GATA4P43694 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GATA4P43694 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GATA4P43694 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GATA4P43694 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GATA4P43694 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GATA4P43694 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GATA4P43694 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GATA4P43694 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GATA4P43694 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms