Protein–RNA interactions for Protein: P42025

ACTR1B, Beta-centractin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1BP42025 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ACTR1BP42025 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms