Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
APOBEC1P41238 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC1P41238 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms