Protein–RNA interactions for Protein: P40198

CEACAM3, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM3P40198 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CEACAM3P40198 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms