Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXD13P35453 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms