Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DSG3P32926 ADAM3A-209ENST00000497806 1245 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DSG3P32926 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DSG3P32926 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DSG3P32926 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DSG3P32926 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
DSG3P32926 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
DSG3P32926 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DSG3P32926 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DSG3P32926 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DSG3P32926 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DSG3P32926 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DSG3P32926 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DSG3P32926 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DSG3P32926 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
DSG3P32926 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DSG3P32926 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DSG3P32926 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DSG3P32926 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DSG3P32926 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DSG3P32926 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DSG3P32926 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DSG3P32926 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DSG3P32926 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DSG3P32926 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DSG3P32926 QTRT2-209ENST00000479882 1196 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DSG3P32926 AP000842.3-201ENST00000564354 808 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DSG3P32926 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DSG3P32926 AC010618.2-201ENST00000596192 460 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DSG3P32926 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DSG3P32926 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
DSG3P32926 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DSG3P32926 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DSG3P32926 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DSG3P32926 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DSG3P32926 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DSG3P32926 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DSG3P32926 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DSG3P32926 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DSG3P32926 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DSG3P32926 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DSG3P32926 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
DSG3P32926 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DSG3P32926 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DSG3P32926 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DSG3P32926 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DSG3P32926 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DSG3P32926 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DSG3P32926 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DSG3P32926 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DSG3P32926 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DSG3P32926 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DSG3P32926 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DSG3P32926 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DSG3P32926 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DSG3P32926 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DSG3P32926 AL096869.2-202ENST00000557007 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DSG3P32926 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DSG3P32926 AC097478.2-201ENST00000610572 514 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
DSG3P32926 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DSG3P32926 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DSG3P32926 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DSG3P32926 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DSG3P32926 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DSG3P32926 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DSG3P32926 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DSG3P32926 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DSG3P32926 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DSG3P32926 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
DSG3P32926 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DSG3P32926 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DSG3P32926 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DSG3P32926 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DSG3P32926 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DSG3P32926 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
DSG3P32926 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DSG3P32926 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
DSG3P32926 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DSG3P32926 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DSG3P32926 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DSG3P32926 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
DSG3P32926 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
DSG3P32926 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DSG3P32926 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
DSG3P32926 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DSG3P32926 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DSG3P32926 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DSG3P32926 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DSG3P32926 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DSG3P32926 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DSG3P32926 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DSG3P32926 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DSG3P32926 IL4-201ENST00000231449 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DSG3P32926 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DSG3P32926 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
DSG3P32926 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DSG3P32926 AC108718.1-201ENST00000482382 554 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DSG3P32926 AC055748.1-201ENST00000489836 959 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
DSG3P32926 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DSG3P32926 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms