Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CLIP1P30622 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CLIP1P30622 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CLIP1P30622 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CLIP1P30622 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
CLIP1P30622 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CLIP1P30622 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
CLIP1P30622 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CLIP1P30622 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CLIP1P30622 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CLIP1P30622 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CLIP1P30622 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CLIP1P30622 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CLIP1P30622 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CLIP1P30622 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CLIP1P30622 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CLIP1P30622 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CLIP1P30622 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CLIP1P30622 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CLIP1P30622 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CLIP1P30622 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CLIP1P30622 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
CLIP1P30622 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CLIP1P30622 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CLIP1P30622 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CLIP1P30622 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CLIP1P30622 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
CLIP1P30622 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
CLIP1P30622 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
CLIP1P30622 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
CLIP1P30622 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CLIP1P30622 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CLIP1P30622 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CLIP1P30622 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CLIP1P30622 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CLIP1P30622 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CLIP1P30622 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CLIP1P30622 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CLIP1P30622 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CLIP1P30622 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CLIP1P30622 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CLIP1P30622 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CLIP1P30622 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CLIP1P30622 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
CLIP1P30622 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CLIP1P30622 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CLIP1P30622 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CLIP1P30622 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CLIP1P30622 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CLIP1P30622 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CLIP1P30622 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CLIP1P30622 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CLIP1P30622 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
CLIP1P30622 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CLIP1P30622 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CLIP1P30622 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
CLIP1P30622 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
CLIP1P30622 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CLIP1P30622 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
CLIP1P30622 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.37
CLIP1P30622 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CLIP1P30622 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CLIP1P30622 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CLIP1P30622 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
CLIP1P30622 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CLIP1P30622 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CLIP1P30622 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CLIP1P30622 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CLIP1P30622 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CLIP1P30622 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CLIP1P30622 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CLIP1P30622 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CLIP1P30622 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CLIP1P30622 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CLIP1P30622 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CLIP1P30622 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CLIP1P30622 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CLIP1P30622 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CLIP1P30622 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CLIP1P30622 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CLIP1P30622 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CLIP1P30622 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CLIP1P30622 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CLIP1P30622 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CLIP1P30622 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CLIP1P30622 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CLIP1P30622 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CLIP1P30622 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CLIP1P30622 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CLIP1P30622 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CLIP1P30622 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CLIP1P30622 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CLIP1P30622 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CLIP1P30622 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CLIP1P30622 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CLIP1P30622 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CLIP1P30622 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CLIP1P30622 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CLIP1P30622 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CLIP1P30622 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms