Protein–RNA interactions for Protein: P29016

CD1B, T-cell surface glycoprotein CD1b, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD1BP29016 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD1BP29016 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD1BP29016 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD1BP29016 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD1BP29016 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD1BP29016 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD1BP29016 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD1BP29016 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD1BP29016 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD1BP29016 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD1BP29016 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CD1BP29016 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD1BP29016 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD1BP29016 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD1BP29016 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD1BP29016 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD1BP29016 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD1BP29016 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD1BP29016 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CD1BP29016 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD1BP29016 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD1BP29016 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD1BP29016 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD1BP29016 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD1BP29016 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD1BP29016 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD1BP29016 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD1BP29016 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD1BP29016 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD1BP29016 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD1BP29016 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD1BP29016 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CD1BP29016 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD1BP29016 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CD1BP29016 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD1BP29016 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD1BP29016 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD1BP29016 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CD1BP29016 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD1BP29016 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD1BP29016 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD1BP29016 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD1BP29016 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD1BP29016 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CD1BP29016 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD1BP29016 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CD1BP29016 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD1BP29016 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD1BP29016 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD1BP29016 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD1BP29016 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD1BP29016 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD1BP29016 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD1BP29016 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD1BP29016 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CD1BP29016 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD1BP29016 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD1BP29016 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD1BP29016 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD1BP29016 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD1BP29016 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD1BP29016 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD1BP29016 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD1BP29016 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD1BP29016 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CD1BP29016 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD1BP29016 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD1BP29016 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD1BP29016 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CD1BP29016 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CD1BP29016 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CD1BP29016 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CD1BP29016 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD1BP29016 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD1BP29016 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD1BP29016 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CD1BP29016 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD1BP29016 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD1BP29016 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD1BP29016 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD1BP29016 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD1BP29016 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD1BP29016 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD1BP29016 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD1BP29016 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD1BP29016 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD1BP29016 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD1BP29016 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD1BP29016 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CD1BP29016 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CD1BP29016 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CD1BP29016 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CD1BP29016 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CD1BP29016 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
CD1BP29016 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CD1BP29016 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD1BP29016 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD1BP29016 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD1BP29016 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD1BP29016 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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