Protein–RNA interactions for Protein: P28906

CD34, Hematopoietic progenitor cell antigen CD34, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD34P28906 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD34P28906 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD34P28906 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD34P28906 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD34P28906 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CD34P28906 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD34P28906 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD34P28906 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD34P28906 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD34P28906 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD34P28906 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD34P28906 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD34P28906 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD34P28906 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD34P28906 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD34P28906 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD34P28906 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD34P28906 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CD34P28906 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD34P28906 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD34P28906 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD34P28906 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD34P28906 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD34P28906 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD34P28906 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD34P28906 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD34P28906 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD34P28906 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD34P28906 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD34P28906 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CD34P28906 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CD34P28906 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD34P28906 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD34P28906 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD34P28906 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD34P28906 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD34P28906 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CD34P28906 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD34P28906 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD34P28906 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CD34P28906 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD34P28906 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD34P28906 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD34P28906 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD34P28906 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD34P28906 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD34P28906 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD34P28906 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD34P28906 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD34P28906 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CD34P28906 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD34P28906 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD34P28906 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD34P28906 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD34P28906 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD34P28906 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD34P28906 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD34P28906 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD34P28906 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD34P28906 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD34P28906 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD34P28906 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD34P28906 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD34P28906 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CD34P28906 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD34P28906 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD34P28906 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD34P28906 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD34P28906 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD34P28906 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD34P28906 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD34P28906 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD34P28906 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD34P28906 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD34P28906 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD34P28906 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD34P28906 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD34P28906 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD34P28906 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD34P28906 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD34P28906 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD34P28906 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CD34P28906 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD34P28906 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD34P28906 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD34P28906 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD34P28906 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD34P28906 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD34P28906 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD34P28906 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD34P28906 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD34P28906 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD34P28906 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD34P28906 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD34P28906 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD34P28906 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD34P28906 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD34P28906 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD34P28906 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CD34P28906 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms