Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTGS1P23219 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTGS1P23219 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTGS1P23219 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTGS1P23219 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTGS1P23219 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTGS1P23219 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTGS1P23219 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTGS1P23219 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTGS1P23219 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTGS1P23219 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTGS1P23219 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTGS1P23219 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTGS1P23219 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PTGS1P23219 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTGS1P23219 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTGS1P23219 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTGS1P23219 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTGS1P23219 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTGS1P23219 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTGS1P23219 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTGS1P23219 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTGS1P23219 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTGS1P23219 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTGS1P23219 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTGS1P23219 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTGS1P23219 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTGS1P23219 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTGS1P23219 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTGS1P23219 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTGS1P23219 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTGS1P23219 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTGS1P23219 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTGS1P23219 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTGS1P23219 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTGS1P23219 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTGS1P23219 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PTGS1P23219 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTGS1P23219 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTGS1P23219 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTGS1P23219 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTGS1P23219 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTGS1P23219 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTGS1P23219 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTGS1P23219 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTGS1P23219 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTGS1P23219 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTGS1P23219 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTGS1P23219 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTGS1P23219 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTGS1P23219 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTGS1P23219 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTGS1P23219 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTGS1P23219 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTGS1P23219 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PTGS1P23219 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTGS1P23219 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTGS1P23219 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTGS1P23219 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTGS1P23219 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PTGS1P23219 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTGS1P23219 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTGS1P23219 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTGS1P23219 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTGS1P23219 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTGS1P23219 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTGS1P23219 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTGS1P23219 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTGS1P23219 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTGS1P23219 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTGS1P23219 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTGS1P23219 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTGS1P23219 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTGS1P23219 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTGS1P23219 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTGS1P23219 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTGS1P23219 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTGS1P23219 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTGS1P23219 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTGS1P23219 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTGS1P23219 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTGS1P23219 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTGS1P23219 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTGS1P23219 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTGS1P23219 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PTGS1P23219 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTGS1P23219 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTGS1P23219 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTGS1P23219 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTGS1P23219 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTGS1P23219 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PTGS1P23219 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTGS1P23219 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTGS1P23219 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTGS1P23219 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTGS1P23219 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTGS1P23219 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTGS1P23219 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTGS1P23219 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTGS1P23219 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms