Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDSP20132 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDSP20132 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDSP20132 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDSP20132 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDSP20132 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDSP20132 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDSP20132 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDSP20132 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDSP20132 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SDSP20132 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDSP20132 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDSP20132 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDSP20132 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDSP20132 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDSP20132 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SDSP20132 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDSP20132 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDSP20132 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDSP20132 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDSP20132 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDSP20132 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDSP20132 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SDSP20132 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDSP20132 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SDSP20132 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDSP20132 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDSP20132 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDSP20132 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDSP20132 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDSP20132 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDSP20132 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDSP20132 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDSP20132 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDSP20132 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SDSP20132 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDSP20132 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDSP20132 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDSP20132 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDSP20132 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDSP20132 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDSP20132 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDSP20132 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDSP20132 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDSP20132 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDSP20132 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDSP20132 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDSP20132 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDSP20132 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDSP20132 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDSP20132 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDSP20132 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDSP20132 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDSP20132 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDSP20132 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDSP20132 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDSP20132 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDSP20132 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDSP20132 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDSP20132 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDSP20132 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDSP20132 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDSP20132 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDSP20132 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SDSP20132 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDSP20132 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDSP20132 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDSP20132 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDSP20132 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDSP20132 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDSP20132 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SDSP20132 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDSP20132 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDSP20132 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDSP20132 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDSP20132 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SDSP20132 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDSP20132 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SDSP20132 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDSP20132 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDSP20132 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDSP20132 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDSP20132 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SDSP20132 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDSP20132 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDSP20132 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDSP20132 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDSP20132 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDSP20132 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDSP20132 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDSP20132 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDSP20132 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDSP20132 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDSP20132 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDSP20132 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SDSP20132 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDSP20132 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SDSP20132 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDSP20132 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SDSP20132 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms