Protein–RNA interactions for Protein: P18545

PDE6G, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6GP18545 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PDE6GP18545 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PDE6GP18545 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PDE6GP18545 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PDE6GP18545 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PDE6GP18545 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PDE6GP18545 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
PDE6GP18545 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
PDE6GP18545 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDE6GP18545 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDE6GP18545 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDE6GP18545 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDE6GP18545 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDE6GP18545 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDE6GP18545 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PDE6GP18545 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDE6GP18545 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDE6GP18545 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDE6GP18545 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDE6GP18545 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDE6GP18545 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDE6GP18545 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDE6GP18545 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDE6GP18545 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDE6GP18545 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDE6GP18545 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDE6GP18545 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDE6GP18545 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDE6GP18545 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PDE6GP18545 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PDE6GP18545 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDE6GP18545 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PDE6GP18545 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
PDE6GP18545 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDE6GP18545 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDE6GP18545 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDE6GP18545 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDE6GP18545 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDE6GP18545 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDE6GP18545 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDE6GP18545 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDE6GP18545 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDE6GP18545 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDE6GP18545 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDE6GP18545 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDE6GP18545 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDE6GP18545 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDE6GP18545 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDE6GP18545 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDE6GP18545 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDE6GP18545 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDE6GP18545 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
PDE6GP18545 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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PDE6GP18545 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PDE6GP18545 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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