Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
XBP1P17861 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
XBP1P17861 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
XBP1P17861 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
XBP1P17861 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
XBP1P17861 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
XBP1P17861 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
XBP1P17861 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
XBP1P17861 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
XBP1P17861 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
XBP1P17861 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
XBP1P17861 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
XBP1P17861 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
XBP1P17861 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
XBP1P17861 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
XBP1P17861 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
XBP1P17861 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
XBP1P17861 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
XBP1P17861 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
XBP1P17861 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
XBP1P17861 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
XBP1P17861 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
XBP1P17861 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
XBP1P17861 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
XBP1P17861 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
XBP1P17861 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
XBP1P17861 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
XBP1P17861 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
XBP1P17861 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
XBP1P17861 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
XBP1P17861 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
XBP1P17861 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
XBP1P17861 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
XBP1P17861 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
XBP1P17861 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
XBP1P17861 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
XBP1P17861 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
XBP1P17861 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
XBP1P17861 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
XBP1P17861 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
XBP1P17861 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
XBP1P17861 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
XBP1P17861 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
XBP1P17861 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
XBP1P17861 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
XBP1P17861 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
XBP1P17861 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
XBP1P17861 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
XBP1P17861 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
XBP1P17861 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
XBP1P17861 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
XBP1P17861 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
XBP1P17861 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
XBP1P17861 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
XBP1P17861 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
XBP1P17861 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
XBP1P17861 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
XBP1P17861 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
XBP1P17861 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
XBP1P17861 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
XBP1P17861 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
XBP1P17861 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
XBP1P17861 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
XBP1P17861 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
XBP1P17861 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
XBP1P17861 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
XBP1P17861 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
XBP1P17861 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
XBP1P17861 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
XBP1P17861 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
XBP1P17861 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
XBP1P17861 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
XBP1P17861 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
XBP1P17861 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
XBP1P17861 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
XBP1P17861 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
XBP1P17861 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
XBP1P17861 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
XBP1P17861 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
XBP1P17861 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
XBP1P17861 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
XBP1P17861 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
XBP1P17861 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
XBP1P17861 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
XBP1P17861 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
XBP1P17861 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
XBP1P17861 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
XBP1P17861 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
XBP1P17861 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
XBP1P17861 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
XBP1P17861 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
XBP1P17861 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
XBP1P17861 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
XBP1P17861 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
XBP1P17861 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
XBP1P17861 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
XBP1P17861 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
XBP1P17861 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
XBP1P17861 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
XBP1P17861 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms