Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGB4P16144 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGB4P16144 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms