Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TRIM27P14373 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms