Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRG2P13727 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRG2P13727 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRG2P13727 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRG2P13727 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRG2P13727 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRG2P13727 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRG2P13727 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRG2P13727 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRG2P13727 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRG2P13727 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PRG2P13727 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRG2P13727 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRG2P13727 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRG2P13727 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRG2P13727 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRG2P13727 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRG2P13727 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRG2P13727 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRG2P13727 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRG2P13727 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRG2P13727 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRG2P13727 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRG2P13727 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRG2P13727 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRG2P13727 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRG2P13727 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRG2P13727 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRG2P13727 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRG2P13727 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PRG2P13727 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PRG2P13727 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRG2P13727 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRG2P13727 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRG2P13727 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PRG2P13727 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRG2P13727 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRG2P13727 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRG2P13727 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRG2P13727 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRG2P13727 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRG2P13727 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRG2P13727 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRG2P13727 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRG2P13727 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRG2P13727 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRG2P13727 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRG2P13727 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRG2P13727 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRG2P13727 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRG2P13727 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRG2P13727 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRG2P13727 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRG2P13727 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRG2P13727 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRG2P13727 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRG2P13727 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRG2P13727 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRG2P13727 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRG2P13727 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRG2P13727 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRG2P13727 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRG2P13727 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRG2P13727 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRG2P13727 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRG2P13727 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PRG2P13727 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRG2P13727 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRG2P13727 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRG2P13727 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRG2P13727 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRG2P13727 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRG2P13727 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRG2P13727 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRG2P13727 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PRG2P13727 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRG2P13727 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRG2P13727 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRG2P13727 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRG2P13727 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRG2P13727 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRG2P13727 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRG2P13727 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRG2P13727 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRG2P13727 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRG2P13727 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRG2P13727 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRG2P13727 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRG2P13727 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRG2P13727 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRG2P13727 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRG2P13727 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRG2P13727 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRG2P13727 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRG2P13727 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRG2P13727 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PRG2P13727 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PRG2P13727 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRG2P13727 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRG2P13727 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms