Protein–RNA interactions for Protein: P13682

ZNF35, Zinc finger protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF35P13682 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF35P13682 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF35P13682 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF35P13682 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ZNF35P13682 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ZNF35P13682 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms