Protein–RNA interactions for Protein: P10911

MCF2, Proto-oncogene DBL, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2P10911 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MCF2P10911 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MCF2P10911 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MCF2P10911 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MCF2P10911 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MCF2P10911 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MCF2P10911 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MCF2P10911 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MCF2P10911 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MCF2P10911 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MCF2P10911 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MCF2P10911 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MCF2P10911 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MCF2P10911 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MCF2P10911 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MCF2P10911 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MCF2P10911 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MCF2P10911 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MCF2P10911 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
MCF2P10911 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MCF2P10911 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MCF2P10911 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MCF2P10911 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MCF2P10911 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MCF2P10911 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MCF2P10911 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
MCF2P10911 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MCF2P10911 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MCF2P10911 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MCF2P10911 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MCF2P10911 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MCF2P10911 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MCF2P10911 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MCF2P10911 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MCF2P10911 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MCF2P10911 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
MCF2P10911 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
MCF2P10911 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MCF2P10911 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
MCF2P10911 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
MCF2P10911 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MCF2P10911 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MCF2P10911 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MCF2P10911 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MCF2P10911 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
MCF2P10911 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
MCF2P10911 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MCF2P10911 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MCF2P10911 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MCF2P10911 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MCF2P10911 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MCF2P10911 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
MCF2P10911 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
MCF2P10911 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
MCF2P10911 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MCF2P10911 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
MCF2P10911 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MCF2P10911 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MCF2P10911 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
MCF2P10911 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MCF2P10911 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MCF2P10911 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MCF2P10911 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
MCF2P10911 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MCF2P10911 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
MCF2P10911 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MCF2P10911 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MCF2P10911 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MCF2P10911 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MCF2P10911 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MCF2P10911 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MCF2P10911 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MCF2P10911 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MCF2P10911 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MCF2P10911 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MCF2P10911 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MCF2P10911 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
MCF2P10911 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MCF2P10911 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MCF2P10911 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MCF2P10911 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
MCF2P10911 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MCF2P10911 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MCF2P10911 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MCF2P10911 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MCF2P10911 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
MCF2P10911 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MCF2P10911 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MCF2P10911 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MCF2P10911 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MCF2P10911 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MCF2P10911 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MCF2P10911 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
MCF2P10911 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
MCF2P10911 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MCF2P10911 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MCF2P10911 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MCF2P10911 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MCF2P10911 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
MCF2P10911 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms