Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HKR1P10072 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HKR1P10072 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HKR1P10072 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HKR1P10072 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HKR1P10072 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HKR1P10072 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HKR1P10072 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HKR1P10072 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HKR1P10072 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HKR1P10072 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HKR1P10072 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HKR1P10072 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HKR1P10072 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HKR1P10072 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HKR1P10072 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HKR1P10072 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HKR1P10072 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HKR1P10072 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HKR1P10072 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HKR1P10072 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HKR1P10072 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HKR1P10072 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HKR1P10072 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HKR1P10072 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HKR1P10072 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HKR1P10072 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HKR1P10072 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HKR1P10072 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HKR1P10072 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HKR1P10072 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HKR1P10072 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HKR1P10072 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HKR1P10072 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HKR1P10072 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HKR1P10072 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HKR1P10072 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HKR1P10072 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HKR1P10072 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HKR1P10072 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HKR1P10072 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HKR1P10072 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HKR1P10072 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HKR1P10072 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HKR1P10072 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HKR1P10072 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HKR1P10072 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HKR1P10072 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HKR1P10072 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HKR1P10072 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HKR1P10072 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HKR1P10072 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HKR1P10072 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HKR1P10072 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HKR1P10072 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HKR1P10072 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HKR1P10072 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HKR1P10072 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HKR1P10072 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HKR1P10072 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HKR1P10072 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HKR1P10072 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HKR1P10072 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HKR1P10072 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HKR1P10072 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HKR1P10072 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HKR1P10072 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HKR1P10072 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HKR1P10072 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HKR1P10072 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HKR1P10072 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HKR1P10072 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HKR1P10072 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HKR1P10072 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HKR1P10072 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HKR1P10072 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HKR1P10072 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HKR1P10072 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HKR1P10072 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HKR1P10072 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HKR1P10072 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HKR1P10072 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HKR1P10072 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HKR1P10072 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HKR1P10072 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HKR1P10072 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HKR1P10072 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HKR1P10072 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HKR1P10072 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HKR1P10072 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HKR1P10072 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HKR1P10072 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HKR1P10072 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HKR1P10072 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HKR1P10072 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HKR1P10072 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HKR1P10072 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HKR1P10072 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HKR1P10072 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HKR1P10072 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms